122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1382 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  59.39 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  62.28 
 
 
264 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  61.02 
 
 
259 aa  285  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  54.72 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  57.96 
 
 
256 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  55.02 
 
 
256 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  48.56 
 
 
252 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  51.11 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  50.67 
 
 
252 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  46.38 
 
 
261 aa  208  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  45.61 
 
 
262 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  48.25 
 
 
250 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  44.44 
 
 
260 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  46.82 
 
 
255 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  43.43 
 
 
267 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  44.35 
 
 
266 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  41.53 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  44.2 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  42.36 
 
 
332 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  42.29 
 
 
256 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  43.48 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  44.14 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  42.44 
 
 
256 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  42.92 
 
 
257 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  39.92 
 
 
257 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  44.14 
 
 
259 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  44.59 
 
 
259 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  43.88 
 
 
256 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  42.48 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  43.69 
 
 
278 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  42.06 
 
 
244 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  41.35 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  43.69 
 
 
268 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  42.99 
 
 
263 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  41.56 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  41.44 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  43.36 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  43.29 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  43.89 
 
 
255 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  41.4 
 
 
265 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  44.34 
 
 
259 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  42.26 
 
 
257 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  37.7 
 
 
289 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  40.81 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  40.09 
 
 
231 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  37.78 
 
 
226 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  42.55 
 
 
257 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  40.42 
 
 
255 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  41.23 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  39.91 
 
 
229 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  41.26 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  39.81 
 
 
263 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  42.34 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  39.81 
 
 
263 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  40.18 
 
 
232 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  40.71 
 
 
270 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 
286 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  40.72 
 
 
230 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  39.34 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  39.34 
 
 
263 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  38.02 
 
 
276 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  40.61 
 
 
255 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  39.74 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  40.45 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  38.19 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  42.38 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  38.36 
 
 
249 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  41.2 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  39.74 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  37.84 
 
 
236 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  37.5 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  38.67 
 
 
268 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  39.11 
 
 
283 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  38.94 
 
 
232 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  36.91 
 
 
234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  37.71 
 
 
274 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  37.25 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  37.79 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  35.14 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  39.3 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  35.19 
 
 
249 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  34.98 
 
 
233 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  37.57 
 
 
200 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  28.63 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  33.56 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  33.56 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  28.99 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 
245 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  26.69 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  29.88 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>