49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2884 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  100 
 
 		 882 aa  1654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  50.89 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  83.47 
 
 		 890 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  43.97 
 
 		 802 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  44.24 
 
 		 708 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  44.24 
 
 		 708 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  50.55 
 
 		 685 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  46.7 
 
 		 710 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  44.26 
 
 		 752 aa  127  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  46.45 
 
 		 694 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  63.95 
 
 		 844 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  63.95 
 
 		 882 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  63.95 
 
 		 190 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  70 
 
 		 881 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  70 
 
 		 875 aa  97.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  70 
 
 		 875 aa  97.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  70 
 
 		 881 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  70 
 
 		 875 aa  97.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.81 
 
 		 903 aa  52.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 302 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  58.14 
 
 		 806 aa  52.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.68 
 
 		 561 aa  51.6  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  46.15 
 
 		 968 aa  51.2  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  46.15 
 
 		 969 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  45.1 
 
 		 962 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  39.86 
 
 		 510 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  45.93 
 
 		 996 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 940 aa  48.9  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  34.94 
 
 		 673 aa  48.5  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  50 
 
 		 947 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  50 
 
 		 948 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  32.76 
 
 		 334 aa  48.5  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 911 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 896 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 912 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 911 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1036 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 		 952 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 883 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  50 
 
 		 883 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1041 aa  45.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  28.71 
 
 		 2821 aa  45.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  40.28 
 
 		 658 aa  44.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  30.88 
 
 		 331 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  29.58 
 
 		 333 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  51.16 
 
 		 722 aa  44.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  29.58 
 
 		 333 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  51.16 
 
 		 731 aa  44.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>