More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2836 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  100 
 
 
189 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  92.59 
 
 
189 aa  317  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  77.42 
 
 
202 aa  249  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  74.18 
 
 
199 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  73.22 
 
 
199 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  73.22 
 
 
199 aa  234  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  75.88 
 
 
185 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  74.71 
 
 
199 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  74.71 
 
 
199 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  74.71 
 
 
199 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  73.96 
 
 
204 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  75.6 
 
 
208 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  72.78 
 
 
204 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  75.6 
 
 
212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  73.96 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  73.96 
 
 
226 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  73.96 
 
 
226 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  65.57 
 
 
215 aa  187  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  57.37 
 
 
199 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  43.93 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  45.9 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  43.18 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  42.86 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  40.22 
 
 
192 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  39.18 
 
 
178 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.55 
 
 
198 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  42.26 
 
 
192 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  42.6 
 
 
196 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  39.68 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  41.05 
 
 
193 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  38.95 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  40.23 
 
 
193 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  43.53 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  33.33 
 
 
203 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  36.52 
 
 
196 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  35.83 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  33.68 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  36.52 
 
 
202 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  34.83 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  35.67 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  37.13 
 
 
190 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  35.62 
 
 
196 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  32.76 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  35.76 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  39.41 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  38.82 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  38.24 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  38.24 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  36.78 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  31.65 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  33.33 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.29 
 
 
415 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  40.76 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  35.71 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  35.22 
 
 
428 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  38.01 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  37.01 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.05 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  24.24 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  39.29 
 
 
408 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  25.95 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.74 
 
 
441 aa  71.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  32.49 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  37.98 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  35.48 
 
 
450 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  33.9 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  24.39 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  39.25 
 
 
412 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  41.88 
 
 
403 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  43.16 
 
 
403 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  41.03 
 
 
403 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.94 
 
 
405 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.08 
 
 
441 aa  68.2  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  30.08 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  40 
 
 
401 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  40.62 
 
 
396 aa  67.8  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  30.81 
 
 
483 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.88 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.74 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  36.97 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  32.88 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  35.42 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  31.75 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  45.12 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  45.12 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  39.32 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  45.12 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.06 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  45.12 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  34.15 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  37.39 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  45.12 
 
 
401 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  38.33 
 
 
425 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  48.24 
 
 
407 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  31.01 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.53 
 
 
456 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  34.97 
 
 
418 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  25.21 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  35.71 
 
 
454 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.87 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>