More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2442 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  63.04 
 
 		 277 aa  358  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  58.96 
 
 		 278 aa  328  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  59.11 
 
 		 278 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 312 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  45.93 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  45.93 
 
 		 275 aa  268  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 278 aa  265  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 278 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  48.52 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  43.28 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  43.66 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  41.04 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 300 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  31.72 
 
 		 265 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  31.85 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  32.38 
 
 		 432 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  32.18 
 
 		 281 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  29.18 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  31.84 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  25.21 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  29.46 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  32.03 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>