More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3598 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3598  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
449 aa  890    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00360577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3612  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.64 
 
 
448 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  37.07 
 
 
437 aa  289  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  37.02 
 
 
469 aa  276  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  37.02 
 
 
440 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  37.02 
 
 
440 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  37.02 
 
 
440 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  37.02 
 
 
440 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  37.02 
 
 
440 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  36.94 
 
 
441 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  36.94 
 
 
441 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  36.69 
 
 
441 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  36.71 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
440 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  35.97 
 
 
469 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  36.43 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  36.43 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  37.79 
 
 
445 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  37.14 
 
 
443 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  36.43 
 
 
441 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  35.75 
 
 
437 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  35.19 
 
 
454 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  35.31 
 
 
433 aa  263  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  35.07 
 
 
433 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  34.22 
 
 
436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  36.62 
 
 
434 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  36.72 
 
 
432 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  34.62 
 
 
452 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  37.26 
 
 
441 aa  257  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  34.7 
 
 
459 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  34.46 
 
 
443 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  34.16 
 
 
444 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  32.94 
 
 
462 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  34.05 
 
 
432 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 
445 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  33.63 
 
 
433 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  32.79 
 
 
440 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  36.88 
 
 
436 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 
441 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
441 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  33.65 
 
 
442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  34.47 
 
 
455 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  34.38 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  36.66 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  34.38 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  34.38 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  32.2 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  36.15 
 
 
453 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2926  major facilitator transporter  34.35 
 
 
446 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  37.17 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  34.85 
 
 
428 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  33.64 
 
 
435 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  34.88 
 
 
440 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  34.24 
 
 
445 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
449 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  33.26 
 
 
451 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  34.38 
 
 
442 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  32.94 
 
 
432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  36.62 
 
 
466 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  33.17 
 
 
432 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  33.01 
 
 
434 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  33.01 
 
 
434 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  35.87 
 
 
440 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  33.01 
 
 
434 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  33.25 
 
 
435 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  33.01 
 
 
434 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 
444 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
441 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  33.89 
 
 
443 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
441 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  33.25 
 
 
450 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  33.25 
 
 
450 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  35.13 
 
 
435 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
442 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  33.18 
 
 
442 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  34.12 
 
 
442 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  33.01 
 
 
455 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  34.77 
 
 
438 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  32.46 
 
 
442 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  29.67 
 
 
441 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  31.84 
 
 
448 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  31.33 
 
 
436 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  31.33 
 
 
436 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  31.84 
 
 
448 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  32.39 
 
 
434 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  31.84 
 
 
448 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.47 
 
 
442 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  35.55 
 
 
435 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  32.3 
 
 
436 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  31.33 
 
 
436 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
444 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
444 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  32.39 
 
 
434 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  29.19 
 
 
441 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  35.55 
 
 
435 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  31.91 
 
 
445 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
424 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  33.33 
 
 
441 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>