45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1918 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  83.25 
 
 		 201 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  51.49 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  44.95 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  43.33 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  42.78 
 
 		 222 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  42.56 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  43.37 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  40.4 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  39.39 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  39.9 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  43.01 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  34.91 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  37.23 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  36.7 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  36.17 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  35.41 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  30.34 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  35.75 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  30.09 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  27.6 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  30.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  29.47 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  26.63 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  30.27 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  27.44 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  30.65 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 184 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  26.86 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3167  2',5' RNA ligase  23.86 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.592975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>