More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1882 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  82.61 
 
 
232 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  72.6 
 
 
232 aa  324  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  73.36 
 
 
231 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  70.97 
 
 
230 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  69.13 
 
 
233 aa  288  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  69.57 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  69.57 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  69.57 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  69.57 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  69.57 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  69.57 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  62.39 
 
 
232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  67.74 
 
 
228 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  61.64 
 
 
227 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  61.19 
 
 
227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  55.32 
 
 
194 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  43.2 
 
 
231 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 
236 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  41.55 
 
 
231 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  39.01 
 
 
246 aa  168  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  42.23 
 
 
239 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  38.71 
 
 
243 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  43.2 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  41.51 
 
 
233 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  40.67 
 
 
251 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  38.83 
 
 
223 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  39.32 
 
 
229 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  36.1 
 
 
216 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  41.5 
 
 
229 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  41.71 
 
 
228 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 
218 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  40 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  38.5 
 
 
234 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  35.59 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  38.19 
 
 
234 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  35.61 
 
 
228 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.48 
 
 
230 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35 
 
 
229 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  34.5 
 
 
229 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  31.75 
 
 
235 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  37.37 
 
 
220 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  31.6 
 
 
284 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  37.38 
 
 
234 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  34.48 
 
 
229 aa  121  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  35 
 
 
229 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.98 
 
 
241 aa  121  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  33.99 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  34.5 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.94 
 
 
241 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  34.33 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  34.67 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  35.16 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  35.75 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.5 
 
 
229 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  31.4 
 
 
234 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  31.86 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  35.4 
 
 
257 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  31.53 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  28.51 
 
 
233 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  34.87 
 
 
250 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
241 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
241 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  28.95 
 
 
233 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
241 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  31.46 
 
 
252 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  28.06 
 
 
224 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  27.93 
 
 
251 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  35.56 
 
 
241 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  33.79 
 
 
253 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  34.1 
 
 
251 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  30.05 
 
 
251 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  30.05 
 
 
251 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  31.58 
 
 
218 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  29.67 
 
 
246 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  35.11 
 
 
241 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  35.11 
 
 
241 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  33.48 
 
 
261 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  30.05 
 
 
224 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  29.75 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 
188 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  29 
 
 
301 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  29.95 
 
 
271 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  34.59 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  31.1 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  28.3 
 
 
262 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  29.95 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  32.35 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  32.26 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  32.26 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  29.52 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  30.84 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  32.29 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  31.61 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  28.71 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>