More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4359 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
591 aa  1137    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184868  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
596 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
587 aa  240  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
597 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
588 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
606 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
593 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
593 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
550 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957073  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
669 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 
588 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0237049  normal  0.467133 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 
282 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
282 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  35.16 
 
 
282 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
275 aa  161  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0645  polyamine ABC transporter, permease protein  40.81 
 
 
279 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2498  putative polyamine ABC transporter, permease protein  40.81 
 
 
289 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0812  polyamine ABC transporter, permease protein  40.81 
 
 
279 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2359  putative polyamine ABC transporter, permease protein  40.81 
 
 
289 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.78 
 
 
275 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
279 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471707  normal  0.190136 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2930  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  40.81 
 
 
279 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
272 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
272 aa  153  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
272 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
281 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
281 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
276 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282406  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
281 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
275 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
275 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
270 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
275 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
264 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50413  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
278 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735344  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2167  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
278 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00407242  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
281 aa  150  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003666  probable permease of ABC transporter  35.94 
 
 
282 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
261 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.644272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
278 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445054  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
278 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708074  normal  0.0941502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  38.96 
 
 
291 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.97 
 
 
274 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
278 aa  148  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
270 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
272 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1588  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.64 
 
 
279 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148375 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1105  polyamine ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
267 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
278 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
263 aa  146  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
261 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  36.1 
 
 
271 aa  145  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0303  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37 
 
 
242 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
275 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
279 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0750  ABC transporter permease  38.79 
 
 
276 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
274 aa  143  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07900  putative permease of ABC transporter  38.32 
 
 
276 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
280 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475506  normal  0.0258331 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0329  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
258 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
265 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
274 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
275 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  29.09 
 
 
276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
264 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
268 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0474626  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
284 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3472  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  35.68 
 
 
275 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
261 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367092  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
391 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0689786  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  35.42 
 
 
288 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
275 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.776443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
317 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964128  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
317 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  29.84 
 
 
281 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
293 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
279 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
317 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1886  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  33.6 
 
 
302 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0261044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
282 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
302 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  29.84 
 
 
281 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
284 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
264 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  32.23 
 
 
293 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  30.38 
 
 
282 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  30.38 
 
 
282 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
277 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  0.243826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4612  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.79 
 
 
273 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0565  polyamine ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
273 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.903035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
275 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.15 
 
 
264 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1399  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1178  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  31.16 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1180  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  31.16 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00976508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1507  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.01 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375803  normal  0.0420414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>