More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0329 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0329  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
258 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0303  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  99.59 
 
 
242 aa  461  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.06 
 
 
264 aa  417  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.83 
 
 
261 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367092  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.72 
 
 
262 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1611  spermidine/putrescine ABC transporter permease  64.68 
 
 
259 aa  268  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
275 aa  225  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.87 
 
 
275 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0645  polyamine ABC transporter, permease protein  48.79 
 
 
279 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.21 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.16 
 
 
279 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.644272 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0812  polyamine ABC transporter, permease protein  47.98 
 
 
279 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2498  putative polyamine ABC transporter, permease protein  47.98 
 
 
289 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2359  putative polyamine ABC transporter, permease protein  47.98 
 
 
289 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2930  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  48.16 
 
 
279 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.16 
 
 
279 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471707  normal  0.190136 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.68 
 
 
272 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0750  ABC transporter permease  50.43 
 
 
276 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.09 
 
 
272 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07900  putative permease of ABC transporter  50 
 
 
276 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
279 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.41 
 
 
270 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
281 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
281 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
281 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
281 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.02 
 
 
275 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
278 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708074  normal  0.0941502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
278 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445054  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.11 
 
 
275 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2167  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  49.36 
 
 
278 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00407242  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
278 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.36 
 
 
278 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735344  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.18 
 
 
278 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.11 
 
 
275 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  45.73 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  45.73 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.73 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3472  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  44.86 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 
275 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.776443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.16 
 
 
279 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.17 
 
 
274 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
280 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475506  normal  0.0258331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003666  probable permease of ABC transporter  43.91 
 
 
282 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
274 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0565  polyamine ABC transporter, permease protein  49.57 
 
 
273 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.903035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4612  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.13 
 
 
273 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
275 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
284 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2634  Fis family transcriptional regulator  48.62 
 
 
275 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
284 aa  185  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
281 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1886  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  40.08 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0261044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1731  transmembrane ABC transporter protein  46.75 
 
 
272 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271867  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
317 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964128  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
317 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000044635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00468579  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
391 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0689786  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
276 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282406  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.56 
 
 
302 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703183  decreased coverage  0.00406326 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
311 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
268 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0474626  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  36.97 
 
 
265 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
265 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
591 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621124  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
266 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208097 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
596 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
269 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
337 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.494716  normal  0.616088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  40.51 
 
 
264 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.93 
 
 
264 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
597 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
264 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6091  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  38.14 
 
 
266 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417915  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
266 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
266 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
264 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
591 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184868  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
272 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
264 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
268 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
269 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
268 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  36.69 
 
 
256 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
265 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  36.69 
 
 
256 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1105  polyamine ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.25 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1507  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.7 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375803  normal  0.0420414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>