136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2708 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 		 281 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  78.65 
 
 		 281 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  68.46 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  68.82 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  66.79 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  67.15 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  64.29 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  55.81 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  51.62 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  48.48 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  46.18 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  46.59 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  46.21 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  44.61 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  41.38 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  39.54 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  41.04 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  41.04 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  41.04 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  41.04 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  41.04 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  41.04 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  40.51 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  39.1 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  41.15 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  40.07 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  37.55 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  39.02 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  37.64 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  35.88 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  37.64 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  37.64 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  39.46 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  39.46 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  38.95 
 
 		 298 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  36.98 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  38.7 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  36.33 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  36.98 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  36.98 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  37.74 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  37.64 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  35.79 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  37.93 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  37.4 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  35.42 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  35.36 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  37.08 
 
 		 295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  36.15 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  35.34 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  36.14 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  33.84 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  35.42 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  33.08 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  34.33 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  35.95 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  32.46 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  33.09 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  32.7 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  29.74 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  30.98 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  30.12 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  32.85 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  29.93 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  30.28 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  30.08 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  28.47 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  31.5 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.03 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  30.8 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  30.83 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  29.84 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  30.4 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  30.4 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  28.83 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  30.36 
 
 		 270 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  29.53 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  28.34 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  28.8 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  28.85 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  28.69 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.72 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  29.37 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  26.59 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  31.13 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  29.55 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  28.29 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  28.79 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  29.2 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  27.53 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  31.45 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  28.77 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  28.83 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>