More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0505 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0505  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  67.46 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  70.87 
 
 		 215 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  69.52 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  69.42 
 
 		 215 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  66.51 
 
 		 217 aa  277  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  67.49 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  67.49 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  67.49 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  67.49 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  67.49 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  67.49 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  67.49 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  66.99 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3905  hypothetical protein  67 
 
 		 215 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0618479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  68.39 
 
 		 212 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  67 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  64.08 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  64.18 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  62.74 
 
 		 214 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  62.74 
 
 		 214 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  64.18 
 
 		 214 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  64.18 
 
 		 214 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  64.18 
 
 		 214 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  63.11 
 
 		 214 aa  256  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  61.57 
 
 		 224 aa  254  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  56.25 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  36.89 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  30.09 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  38.58 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  34.42 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  35.71 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  33.53 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  34.36 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  32.54 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  36.07 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  36.07 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  34.09 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  34.85 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  31.21 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.88 
 
 		 458 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  35.43 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  31.88 
 
 		 458 aa  68.2  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  37.31 
 
 		 648 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  29.94 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  31.88 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  33.53 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  35.25 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  31.18 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  39.47 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  35.54 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  31.34 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  34.65 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  35.42 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  35.96 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  35.77 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  34.4 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  38.6 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4077  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  33.54 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  47.37 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  31.2 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  36.15 
 
 		 631 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  46.05 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  35.23 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  29.06 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.52 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  28.87 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  28.87 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  28.16 
 
 		 434 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  34.07 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  28.87 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  29.76 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  35.25 
 
 		 463 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 623 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  46.67 
 
 		 434 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  28.87 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>