64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0191 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  67.74 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  64.86 
 
 		 312 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.93 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  53.41 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.74 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  54.74 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  54.21 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  48.98 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  55.15 
 
 		 264 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  37.76 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  38.54 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  38.21 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  38.36 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  38.21 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  37.89 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  37.75 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  37.75 
 
 		 338 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  35.17 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  38.41 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  34.8 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  36.55 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  36.95 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  36.55 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  36.21 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  36.21 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  36.21 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.14 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  36.21 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  36.71 
 
 		 825 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  32 
 
 		 328 aa  99  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  28.68 
 
 		 284 aa  86.3  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  27.57 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  32.06 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  32.06 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  34.42 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.76 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  32.25 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  32.25 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.39 
 
 		 317 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  34.62 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  28.75 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.61 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.82 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  25.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  25.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  25.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  25.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  25.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  25.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  31.33 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  25.95 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.92 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>