More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4893 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4893  response regulator receiver protein  100 
 
 
170 aa  340  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867558  normal  0.279081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1777  response regulator receiver domain-containing protein  95.39 
 
 
152 aa  290  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520822  hitchhiker  0.000000145352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3355  two component Fis family transcriptional regulator  81.58 
 
 
158 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.798424  hitchhiker  0.00000556117 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
955 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
882 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
585 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1297 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
656 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
666 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
666 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
865 aa  74.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  32.77 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36 
 
 
1303 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
708 aa  71.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
245 aa  70.9  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
233 aa  70.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
794 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  38.4 
 
 
725 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
794 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  37.61 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1267 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1338  histidine kinase  35.29 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  34.29 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1431 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1419 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
628 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1287 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
823 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1184 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1557 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1070 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1478 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  32.77 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
889 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
664 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  33.05 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1000 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
701 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  29.75 
 
 
277 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1002 aa  67.8  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
844 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  36.8 
 
 
796 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  33.05 
 
 
226 aa  67.4  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
844 aa  67.4  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 
225 aa  67.4  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  36.97 
 
 
659 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
672 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
663 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
653 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
587 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  27.64 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
989 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  30.89 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
781 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
989 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1344 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.29 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  30.25 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
768 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.83 
 
 
869 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
768 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
768 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
702 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
796 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.8 
 
 
1242 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
654 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  27.01 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  33.6 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.71 
 
 
352 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  33.59 
 
 
988 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 
988 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 
988 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 
988 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  33.59 
 
 
988 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  33.59 
 
 
988 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1331 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  38.1 
 
 
519 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2964  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.43 
 
 
441 aa  64.3  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 
236 aa  63.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
543 aa  63.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000815  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  32.03 
 
 
449 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
242 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  33.33 
 
 
233 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
606 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3286  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.5 
 
 
458 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
345 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  30.89 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  38.74 
 
 
128 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>