More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4646 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6199  3-isopropylmalate dehydratase  58.17 
 
 		 653 aa  773    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0449269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1455  aconitate hydratase domain protein  52.07 
 
 		 646 aa  693    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4646  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 655 aa  1349    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715504  normal  0.524073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0166  aconitate hydratase domain protein  40.61 
 
 		 659 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0129  homoaconitate hydratase family protein  33.18 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.525388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.08 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0741  homoaconitate hydratase family protein  33.41 
 
 		 432 aa  207  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0848  homoaconitate hydratase family protein  33.11 
 
 		 431 aa  207  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.288921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5868  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.68 
 
 		 440 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5387  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.38 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.37135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0110  homoaconitate hydratase family protein  33.48 
 
 		 435 aa  203  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4843  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  41.03 
 
 		 435 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.81 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  33.79 
 
 		 643 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0738  homoaconitate hydratase family protein  32.81 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0990  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.03 
 
 		 423 aa  201  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  32.89 
 
 		 655 aa  200  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0601  3-isopropylmalate dehydratase  32.52 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0420  3-isopropylmalate dehydratase  32.88 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0665356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2175  homoaconitate hydratase family protein  32.07 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2728  homoaconitate hydratase family protein  33.04 
 
 		 439 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  37.35 
 
 		 642 aa  198  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2762  3-isopropylmalate dehydratase  36.12 
 
 		 413 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.452591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  32.66 
 
 		 642 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  31.4 
 
 		 418 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0737  homoaconitate hydratase family protein  32.29 
 
 		 431 aa  196  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1722  homoaconitate hydratase family protein  32.89 
 
 		 432 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.410724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.57 
 
 		 419 aa  192  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  34.62 
 
 		 644 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  33.48 
 
 		 418 aa  192  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.17 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  30.61 
 
 		 419 aa  191  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2017  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.37 
 
 		 419 aa  190  7e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  31.44 
 
 		 471 aa  190  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1900  3-isopropylmalate dehydratase  31.33 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  37.76 
 
 		 643 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2338  homoaconitate hydratase family protein  31.67 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1102  3-isopropylmalate dehydratase  31.71 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30765  3-isopropylmalate dehydratase (aconitase superfamily)  30.61 
 
 		 677 aa  187  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218751  normal  0.726976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  34.3 
 
 		 640 aa  187  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2167  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.46 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  30.91 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.44 
 
 		 477 aa  187  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.08 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1622  homoaconitate hydratase family protein  32.58 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  36.09 
 
 		 429 aa  184  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0724  homoaconitate hydratase family protein  29.69 
 
 		 418 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.694886  normal  0.102444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  31.61 
 
 		 642 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0695  homoaconitate hydratase family protein  35.47 
 
 		 409 aa  183  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.42 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1366  3-isopropylmalate dehydratase  32.67 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.76 
 
 		 424 aa  182  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0798  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.2 
 
 		 429 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  31.15 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  31.15 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  34.09 
 
 		 642 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  31.41 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  31.57 
 
 		 640 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  35 
 
 		 661 aa  180  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.76 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  38.12 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0311  3-isopropylmalate dehydratase  30.79 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.98 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  31.46 
 
 		 639 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  35.21 
 
 		 657 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.45 
 
 		 418 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  30.69 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0376  3-isopropylmalate dehydratase  33.94 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0583  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.36 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  30.6 
 
 		 472 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  35.65 
 
 		 417 aa  178  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.4 
 
 		 429 aa  178  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  31.65 
 
 		 481 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0098  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  29.98 
 
 		 418 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1903  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  31.34 
 
 		 481 aa  178  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0519  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.34 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000192959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3165  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.82 
 
 		 427 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.770733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  32.71 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32.44 
 
 		 417 aa  177  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1938  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.35 
 
 		 468 aa  177  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0436  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.92 
 
 		 424 aa  177  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.560563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.71 
 
 		 420 aa  177  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  30.08 
 
 		 470 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1136  isopropylmalate isomerase large subunit  30.99 
 
 		 468 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1961  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.09 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.58 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  32.21 
 
 		 656 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1546  aconitate hydratase domain protein  31.67 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0624  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32 
 
 		 427 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.588299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1926  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  32 
 
 		 427 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1194  homoaconitate hydratase family protein  29.46 
 
 		 418 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.2 
 
 		 420 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0789  homoaconitate hydratase family protein  29.62 
 
 		 418 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  30.53 
 
 		 473 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  30.77 
 
 		 465 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1910  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.59 
 
 		 428 aa  173  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3709  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.5 
 
 		 427 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.9 
 
 		 425 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2765  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  31.13 
 
 		 473 aa  173  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>