103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1145 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  100 
 
 		 63 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  95.24 
 
 		 63 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  72.13 
 
 		 65 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  65.57 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  65.57 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  67.27 
 
 		 57 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  66.67 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  57.63 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  42.37 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  38.98 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  55.17 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  38.98 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  47.46 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  40.68 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  51.72 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  41.27 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  48.15 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  41.27 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  41.27 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  53.57 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  38.98 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  38.98 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  45.76 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  40 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  44.07 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  47.27 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  40 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  45.76 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  35.59 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  42.37 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  37.5 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  47.27 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  42.37 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  40 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  48.21 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  45.45 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  43.64 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  47.46 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  37.93 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1152  CsbD-like  40.68 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  45 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  38.71 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1175  CsbD-like  40 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  46.43 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1860  CsbD family protein  34.62 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0325591  normal  0.0799558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  42.37 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  36.36 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  41.82 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  35 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  42.37 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1270  hypothetical protein  38.18 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.390747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0165  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  45.45 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  43.08 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2928  CsbD family protein  38.18 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  41.07 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  40 
 
 		 65 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  36.36 
 
 		 65 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  42.37 
 
 		 59 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  41.07 
 
 		 61 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  42.31 
 
 		 55 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  40 
 
 		 77 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  46.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  43.64 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  44.44 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  36.54 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  41.67 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  45.1 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1391  CsbD family protein  42.59 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  42.37 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  38.33 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  44.44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  44.44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  44.44 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  44.44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  44.44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  37.93 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  40.32 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0369  CsbD family protein  40 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  36.36 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  41.82 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  44.23 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  36.36 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  38.18 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  42.11 
 
 		 61 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0274  CsbD-like protein  40 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0152084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  44.23 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  41.82 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  37.93 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>