101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1175 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1175  CsbD-like  100 
 
 		 65 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577345  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5157  CsbD family protein  65.57 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  61.54 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  61.29 
 
 		 65 aa  84.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  63.93 
 
 		 65 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  63.93 
 
 		 65 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  60 
 
 		 65 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  56.92 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  62.3 
 
 		 65 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  62.3 
 
 		 65 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  62.3 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  56.92 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  55.56 
 
 		 63 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  53.85 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  62.07 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  56.92 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  56.92 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  56.92 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  56.92 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  56.92 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  55.38 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  55.74 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  52.94 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  53.12 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  57.38 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  57.81 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  57.81 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1152  CsbD-like  55.38 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  59.32 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  57.14 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0274  CsbD-like protein  57.38 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0152084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0312  CsbD family protein  50.77 
 
 		 72 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  51.56 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  50.77 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  54.1 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  53.23 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3602  CsbD family protein  55.74 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  52.31 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  52.38 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  55.74 
 
 		 67 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02853  hypothetical protein  55.74 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1391  CsbD family protein  52.46 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  55.17 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  50.79 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  50.77 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  49.23 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  53.45 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  53.45 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  51.61 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  54.1 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  50.77 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0369  CsbD family protein  50 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  49.23 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  50 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  50.82 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  52.46 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6641  CsbD family protein  50 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000497108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  50.77 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  49.23 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  47.69 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  50 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  48.39 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  51.72 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  46.77 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  47.54 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  45.16 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  43.55 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  49.23 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  45.16 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2319  CsbD family protein  52.83 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  44.07 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2928  CsbD family protein  41.94 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1270  hypothetical protein  41.94 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.390747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  37.5 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  40.32 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2262  CsbD family protein  42.19 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.860427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1851  CsbD family protein  48.28 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0418  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.1 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.992162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1268  CsbD-like  37.5 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1931  CsbD family protein  43.4 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.403244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2892  CsbD family protein  52.08 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327354  normal  0.0609409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1860  CsbD family protein  33.87 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0325591  normal  0.0799558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1040  hypothetical protein  37.29 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3555  hypothetical protein  31.15 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000794392  normal  0.0690948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  39.29 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  39.29 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  35.59 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>