72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0144 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  95.41 
 
 		 109 aa  207  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  77.98 
 
 		 108 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  66.34 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  49.47 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  49.45 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  46.24 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  47.83 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  44.94 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  49.3 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  51.39 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  39.56 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  39.02 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  39.47 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  40.54 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  38.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  34.85 
 
 		 395 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  40.32 
 
 		 394 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  45.9 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  38.03 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  36.76 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  30.88 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 403 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 403 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 403 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 403 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 300 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 403 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>