81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1708 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 264 aa  536  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  72.08 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  71.02 
 
 		 283 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  55.14 
 
 		 253 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  51.85 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  47.83 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  47.08 
 
 		 274 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  48.18 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  48.85 
 
 		 495 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  47.08 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  47.08 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  47.08 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.12 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  46.37 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  43.24 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  46.37 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  43.66 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  44.49 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  41.34 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  37.98 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  37.98 
 
 		 279 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  42.03 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  42.21 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  40.38 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  39.61 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  39.75 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  40.08 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.43 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  37.09 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.53 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.97 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  35.27 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  33.59 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  34.93 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  36.95 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  51.2 
 
 		 126 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  41.53 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  36.51 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  34.38 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  34.26 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  30.15 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  36.11 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  32.53 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  39.7 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  34.48 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  34.27 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  32.6 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  33.94 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  37.69 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  33.88 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.92 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  26.88 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  32.71 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  24.61 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  32.71 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  32.24 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  27.14 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  24.72 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  26.8 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  30.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  26.43 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  24.34 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  26.8 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  27.2 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  24.32 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.25 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  30 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  29.09 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  28.18 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  25.89 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  24.81 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4456  putative transmembrane anti-sigma factor  26.09 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  27.68 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  26.53 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  26.19 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  42.65 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02866  transmembrane regulator protein PrtR  33.66 
 
 		 167 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>