More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1182 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  100 
 
 		 179 aa  349  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  67.06 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  64.16 
 
 		 191 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  64.53 
 
 		 191 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  62.5 
 
 		 175 aa  207  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  60.71 
 
 		 175 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  45.83 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  45.83 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  45.24 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.24 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  45.24 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  45.24 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  45.24 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  45.24 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  39.64 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.24 
 
 		 184 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  40.76 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.22 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.33 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  39.53 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  39.67 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  40.22 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  39.43 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  39.13 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  40.7 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  39.43 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  39.43 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  39.05 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  37.65 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  38.04 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  38.33 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  37.21 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  39.13 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.78 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.63 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  44.77 
 
 		 206 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.46 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  33.33 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  40.33 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  35.39 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  39.66 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  36.78 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  38.76 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  38.1 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  37.02 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  33.53 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  37.57 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.12 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.52 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  35.43 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  32.97 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  35.76 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  35.59 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  34.1 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  32.97 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  35.76 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  33.89 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.33 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.42 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  36.75 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  32.95 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.95 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.73 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.95 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  32.43 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  36.9 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  29.7 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  33.14 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.9 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  35.36 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  35.76 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  30.23 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  35.76 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.29 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  36.63 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  38.6 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  35.76 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  26.95 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03827  putative cytochrome b561  32.53 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.71 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  32 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  29.51 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  31.94 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  41.07 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  36.31 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  38.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  38.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  38.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  38.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.35 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  38.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  38.37 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  36.26 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  35.93 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  29.71 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  27.84 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.55 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  30.69 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  31.61 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>