More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1498 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 435 aa  890    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  48.37 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  45.67 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  48.5 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  45.58 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.26 
 
 		 731 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  48.06 
 
 		 441 aa  378  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  46.34 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  45.94 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  42.59 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  44.68 
 
 		 416 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  42.34 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  44.32 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.04 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  44.29 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  46.25 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  44.18 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  44.19 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.71 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  44.93 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  43.62 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  44.08 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  43.28 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  43.12 
 
 		 726 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  43.05 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  46.15 
 
 		 447 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  45.11 
 
 		 458 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  43.81 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  43.71 
 
 		 436 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  43.44 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  42.21 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  41.86 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  41.86 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  41.86 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  44.34 
 
 		 739 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  42.07 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  41.84 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  43.47 
 
 		 441 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  43.53 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  44.74 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  42.15 
 
 		 441 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  44.68 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  42.24 
 
 		 456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  41.28 
 
 		 436 aa  353  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  43.23 
 
 		 440 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  41.36 
 
 		 735 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  42.73 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  43.52 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  42.76 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  43.69 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  40.86 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.55 
 
 		 721 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  44.07 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  39.86 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  43.22 
 
 		 734 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.79 
 
 		 733 aa  343  5e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  39.91 
 
 		 519 aa  343  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  39.63 
 
 		 463 aa  342  5.999999999999999e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  42.24 
 
 		 457 aa  342  7e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  40.71 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  42.5 
 
 		 428 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  43.33 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  43.03 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  41.27 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  39.95 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  43.72 
 
 		 443 aa  340  4e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  41.86 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  42.4 
 
 		 462 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  42.08 
 
 		 452 aa  339  7e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  41.53 
 
 		 457 aa  338  9e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  43.47 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  42.32 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  42.07 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  41.59 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  44.02 
 
 		 423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  41.84 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  41.53 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 437 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  41.31 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  41.98 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  40.09 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  41.46 
 
 		 449 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  41.92 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  41.92 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  41.78 
 
 		 451 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  41.18 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  39.15 
 
 		 453 aa  332  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  45.07 
 
 		 408 aa  332  8e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  42.65 
 
 		 423 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  42.52 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2258  recombination factor protein RarA  38.22 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.658353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  42.62 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  45.82 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>