More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3100 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  587  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  84.03 
 
 		 318 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  83.76 
 
 		 314 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 314 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  83.76 
 
 		 314 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  84.31 
 
 		 314 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  83.66 
 
 		 314 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  76.41 
 
 		 321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  76.41 
 
 		 314 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  73.14 
 
 		 314 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  67.23 
 
 		 328 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  63.61 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  50.52 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  47.26 
 
 		 311 aa  278  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  50.51 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  48.65 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 323 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  43.49 
 
 		 346 aa  241  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  40.62 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  43.42 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  43.94 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  43 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  40.27 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.93 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  39.93 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  39.93 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 375 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  37.25 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  31.16 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  38.91 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  35.19 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  37.65 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  33.67 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  32.78 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  35.82 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  36.07 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  34.7 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  35.95 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2978  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  35.55 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  32.99 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  34.42 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>