More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2564 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.66 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.22 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.28 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.17 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  29.78 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  27.55 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.28 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  24.64 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  22.87 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  31.67 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  22.87 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  25.4 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.46 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.48 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  21.84 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  22.13 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  24.83 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.46 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.9 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  22.68 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  23.6 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  27.14 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.69 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.65 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  21.43 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>