More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2088 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  69.89 
 
 		 289 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  68.33 
 
 		 284 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  65.48 
 
 		 283 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  65.12 
 
 		 284 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  63.35 
 
 		 281 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  62.99 
 
 		 284 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  60.28 
 
 		 290 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  59.17 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  61.79 
 
 		 323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  57.19 
 
 		 296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  59.46 
 
 		 296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  57.53 
 
 		 296 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  59.22 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  56.64 
 
 		 356 aa  351  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.58 
 
 		 639 aa  348  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  57.49 
 
 		 336 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  58.89 
 
 		 293 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  59.01 
 
 		 334 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  56.79 
 
 		 336 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  58.48 
 
 		 293 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  57.24 
 
 		 321 aa  335  7e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  55.99 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  55.63 
 
 		 323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  55.4 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  52.92 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  52.48 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  52.11 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  55 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  53.05 
 
 		 290 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  53.05 
 
 		 290 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  53.05 
 
 		 290 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  47.85 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  49.82 
 
 		 323 aa  291  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  52.69 
 
 		 287 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 		 296 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  51.43 
 
 		 289 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  47.31 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  47.6 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  52.14 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.58 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  51.23 
 
 		 291 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  48.4 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  46.62 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  48.42 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  48.97 
 
 		 296 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  45.64 
 
 		 323 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  47.04 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  39.48 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  41.52 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  39.57 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  56.56 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 		 99 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  23.38 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  50.7 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  28.81 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  36.19 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  25.27 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  31.21 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.92 
 
 		 602 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>