More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0178 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  76.67 
 
 		 251 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  72.02 
 
 		 265 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  67.36 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  65.98 
 
 		 249 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  67.78 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  64.75 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  61.32 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  60 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  60.5 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  60.83 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  59.83 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  59.18 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  57.98 
 
 		 254 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  58.58 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  58.58 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.56 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  59.34 
 
 		 304 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  57.98 
 
 		 270 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  59.34 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  60.83 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  58.16 
 
 		 297 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  58.92 
 
 		 299 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  57.32 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  61.18 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  53.66 
 
 		 298 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  60 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  50.42 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 		 237 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  47.25 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  47.22 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  41.07 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  44.29 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  45.87 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.4 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  39.39 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  39.3 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.13 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.56 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  39.91 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  38.1 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  38.43 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.35 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.72 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.12 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  34.22 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  39.71 
 
 		 217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  37.93 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  35.17 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  36.4 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  32.03 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.66 
 
 		 278 aa  148  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  34.87 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  37.07 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.21 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  34.2 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  37.99 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  34.93 
 
 		 273 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.68 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  36.89 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.55 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.55 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.55 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.55 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.13 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  35.53 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.81 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  36.68 
 
 		 311 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  38.16 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  34.5 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  35.81 
 
 		 275 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  33.62 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  34.31 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  34.06 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  36.21 
 
 		 300 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.07 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.37 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  34.48 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  34.93 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  35.65 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>