185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20940  glycosyltransferase  100 
 
 
394 aa  793    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  47.69 
 
 
364 aa  265  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08730  glycosyltransferase  41.24 
 
 
407 aa  236  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510164  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3892  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
393 aa  153  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476766  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
408 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
408 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
418 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
403 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.53 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  27.59 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.77 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  27.08 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  21.2 
 
 
415 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
436 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.51 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.19 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  30 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  24.41 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
416 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
379 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  17.63 
 
 
421 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  22.53 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.72 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  20.24 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2939  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.29 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  21.65 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  28.28 
 
 
861 aa  53.5  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.1 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  31.58 
 
 
389 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
476 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
440 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  22.7 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
394 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  29.72 
 
 
349 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
378 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
386 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
372 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  21.48 
 
 
383 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  26.7 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  25 
 
 
723 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  29.03 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>