More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  49.19 
 
 		 899 aa  743    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  50.17 
 
 		 908 aa  769    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  50.39 
 
 		 893 aa  805    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  50.65 
 
 		 908 aa  746    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  48.31 
 
 		 901 aa  750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  48.12 
 
 		 893 aa  730    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  48.02 
 
 		 904 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  50.22 
 
 		 928 aa  756    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  45.96 
 
 		 901 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  50.6 
 
 		 929 aa  768    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  51.32 
 
 		 905 aa  737    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  47.6 
 
 		 902 aa  724    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  49.57 
 
 		 911 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  49.57 
 
 		 906 aa  786    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  49.01 
 
 		 945 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  46.91 
 
 		 949 aa  752    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  51.62 
 
 		 933 aa  805    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  52.49 
 
 		 910 aa  803    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  100 
 
 		 904 aa  1802    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  46.87 
 
 		 908 aa  744    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  50.37 
 
 		 937 aa  768    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  47.19 
 
 		 920 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  50.16 
 
 		 912 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  51.54 
 
 		 904 aa  782    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  49.62 
 
 		 899 aa  758    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  48.58 
 
 		 955 aa  761    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  48.84 
 
 		 894 aa  762    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  48.86 
 
 		 910 aa  732    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  48.75 
 
 		 905 aa  762    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  49.84 
 
 		 889 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  47.19 
 
 		 920 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  52.04 
 
 		 901 aa  794    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  47.73 
 
 		 909 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  48.15 
 
 		 888 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  48.43 
 
 		 917 aa  753    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  46.94 
 
 		 929 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 878 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 891 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 891 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 891 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 877 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  37.06 
 
 		 883 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 877 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.31 
 
 		 877 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 912 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  35.79 
 
 		 876 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 903 aa  539  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  34.21 
 
 		 872 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 906 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 899 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 899 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.51 
 
 		 903 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 902 aa  526  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 870 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 895 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 902 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  36.72 
 
 		 880 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 878 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 885 aa  516  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 888 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  35.58 
 
 		 866 aa  512  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  36.93 
 
 		 937 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  33.7 
 
 		 894 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 888 aa  509  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  35.52 
 
 		 896 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.01 
 
 		 850 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  35.72 
 
 		 879 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  33.52 
 
 		 879 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  35.26 
 
 		 896 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  38.1 
 
 		 906 aa  499  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 928 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 917 aa  499  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 899 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 911 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  35.95 
 
 		 910 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  35.44 
 
 		 924 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 875 aa  490  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 907 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 917 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 917 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  34.54 
 
 		 951 aa  492  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 873 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 917 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  34.02 
 
 		 885 aa  489  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  32.93 
 
 		 896 aa  488  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 897 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 897 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 916 aa  489  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 897 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 888 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  37.04 
 
 		 917 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 917 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>