45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  100 
 
 		 437 aa  853    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  40.76 
 
 		 470 aa  239  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  37.05 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  42.05 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  39.88 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  37.6 
 
 		 502 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  37.76 
 
 		 502 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  34.03 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  37.76 
 
 		 369 aa  169  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  34.79 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  33.42 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  36.45 
 
 		 406 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  39.63 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  35.26 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  33.56 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  35.43 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  30.95 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  33.43 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  34.47 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  33.65 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  32.41 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  32.41 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  35.37 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  33.23 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  31.8 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  30.59 
 
 		 313 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  27.62 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  27.48 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  26.78 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  29.69 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  27.66 
 
 		 205 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  26.4 
 
 		 337 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  29.3 
 
 		 252 aa  54.7  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  33.16 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  29.85 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  27.93 
 
 		 329 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  26.99 
 
 		 339 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  27.45 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0185  hypothetical protein  27.95 
 
 		 269 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.08 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  30.39 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  25.27 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  26.19 
 
 		 338 aa  43.5  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>