More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  50.97 
 
 
284 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.51 
 
 
288 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.59 
 
 
261 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.54 
 
 
269 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.57 
 
 
251 aa  236  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.62 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.59 
 
 
260 aa  235  6e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.64 
 
 
274 aa  234  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.86 
 
 
291 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.86 
 
 
253 aa  234  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.36 
 
 
253 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.09 
 
 
286 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.25 
 
 
261 aa  232  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.2 
 
 
253 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.48 
 
 
286 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  47.58 
 
 
278 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  47.74 
 
 
276 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.56 
 
 
282 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 
254 aa  228  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.35 
 
 
263 aa  228  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
252 aa  228  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.67 
 
 
258 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.94 
 
 
252 aa  226  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.09 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.61 
 
 
304 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.32 
 
 
261 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
251 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.31 
 
 
271 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  42.97 
 
 
272 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
251 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
272 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  47.64 
 
 
273 aa  223  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
272 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.37 
 
 
261 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.09 
 
 
254 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.72 
 
 
304 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.62 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.22 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.44 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 
271 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.6 
 
 
303 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  47.6 
 
 
303 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 
271 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  44.62 
 
 
284 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.33 
 
 
303 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  46.28 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.85 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.82 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  46.89 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.05 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.09 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  44.03 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.09 
 
 
254 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  44.31 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  49.01 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
308 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.98 
 
 
304 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.09 
 
 
254 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  44.63 
 
 
251 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 
287 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  44.79 
 
 
260 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  46.85 
 
 
267 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.26 
 
 
272 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.45 
 
 
251 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.45 
 
 
267 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  48.02 
 
 
269 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.43 
 
 
259 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  43.7 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.84 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  43.24 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.72 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.38 
 
 
307 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.36 
 
 
267 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.9 
 
 
280 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.81 
 
 
272 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.32 
 
 
267 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.49 
 
 
292 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  44.49 
 
 
279 aa  215  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.63 
 
 
251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  44.88 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.66 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.73 
 
 
283 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  45.45 
 
 
259 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  41.98 
 
 
279 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.44 
 
 
259 aa  214  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
264 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.51 
 
 
255 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45.77 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.74 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.25 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.75 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.06 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.1 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>