More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3684 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  100 
 
 
293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  97.27 
 
 
293 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  96.93 
 
 
293 aa  590  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  96.93 
 
 
293 aa  590  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  97.27 
 
 
293 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  96.93 
 
 
293 aa  590  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  97.27 
 
 
293 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  96.93 
 
 
293 aa  590  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  95.56 
 
 
293 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  95.56 
 
 
293 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  90.78 
 
 
293 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  68.6 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  65.19 
 
 
293 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  51.89 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  49.48 
 
 
290 aa  295  7e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  49.66 
 
 
295 aa  290  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  46.69 
 
 
307 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  47.14 
 
 
291 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.28 
 
 
296 aa  269  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.93 
 
 
293 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.12 
 
 
292 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  45.39 
 
 
291 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  45.39 
 
 
291 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  46.4 
 
 
287 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  46.4 
 
 
287 aa  255  8e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.42 
 
 
294 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  43.88 
 
 
297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.71 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.12 
 
 
296 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.86 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  44.86 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.96 
 
 
293 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.75 
 
 
292 aa  231  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.94 
 
 
319 aa  228  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.98 
 
 
305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  43.1 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.13 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  40.69 
 
 
279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.68 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.52 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.11 
 
 
288 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.73 
 
 
296 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.4 
 
 
290 aa  205  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.78 
 
 
300 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.75 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.89 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.67 
 
 
302 aa  200  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.45 
 
 
288 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  38.93 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.42 
 
 
319 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  41.3 
 
 
294 aa  192  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.97 
 
 
306 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  37.96 
 
 
353 aa  188  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  39.25 
 
 
350 aa  188  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  39.11 
 
 
370 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.88 
 
 
293 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 
311 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  35.55 
 
 
352 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  35.31 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 
376 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  36.96 
 
 
380 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 
350 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 
350 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 
350 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.85 
 
 
347 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.89 
 
 
337 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 
354 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  38.95 
 
 
364 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  34.32 
 
 
354 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  34.22 
 
 
352 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  33.99 
 
 
354 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.08 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  36.48 
 
 
350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.81 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  36.48 
 
 
350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  36.48 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  36.48 
 
 
350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  36.81 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  36.48 
 
 
350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.63 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  36.22 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  36.48 
 
 
350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  36.48 
 
 
350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  33.66 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 
354 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 
354 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  34.69 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  35.9 
 
 
351 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.67 
 
 
340 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  35.45 
 
 
312 aa  172  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.13 
 
 
354 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  35.93 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  35.93 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4190  ribosome-associated GTPase  35.93 
 
 
313 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.503952  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  33.88 
 
 
311 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  32.45 
 
 
353 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  36.16 
 
 
350 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>