More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3496 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  83.54 
 
 
243 aa  434  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  83.54 
 
 
243 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  83.13 
 
 
243 aa  433  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  83.95 
 
 
243 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  83.54 
 
 
243 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  83.13 
 
 
243 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  83.13 
 
 
243 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  83.54 
 
 
243 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  81.89 
 
 
243 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.17 
 
 
243 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.4 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.91 
 
 
269 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.59 
 
 
228 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.24 
 
 
222 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.54 
 
 
231 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.56 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.57 
 
 
234 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.42 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.65 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.38 
 
 
212 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.97 
 
 
216 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.65 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.99 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.78 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.17 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.87 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.24 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.58 
 
 
117 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  37.72 
 
 
134 aa  70.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.57 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.58 
 
 
121 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.94 
 
 
121 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.07 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.52 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.69 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.54 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.71 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  36.13 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  36.52 
 
 
134 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.71 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.88 
 
 
144 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 
139 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  36.43 
 
 
154 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.82 
 
 
140 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.43 
 
 
154 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.43 
 
 
141 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.19 
 
 
150 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  36.52 
 
 
134 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.62 
 
 
139 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  33.62 
 
 
139 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.84 
 
 
149 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  34.71 
 
 
143 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
120 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.54 
 
 
147 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.63 
 
 
111 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.93 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.08 
 
 
157 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.4 
 
 
141 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.66 
 
 
140 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.85 
 
 
112 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 
134 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.19 
 
 
108 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.83 
 
 
143 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.83 
 
 
133 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  40 
 
 
110 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.59 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  34.78 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.54 
 
 
138 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  43.86 
 
 
122 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.78 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.41 
 
 
109 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.49 
 
 
110 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.91 
 
 
140 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.25 
 
 
118 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.39 
 
 
121 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  35.14 
 
 
157 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  40.24 
 
 
146 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  33.33 
 
 
118 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.15 
 
 
118 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.48 
 
 
140 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.15 
 
 
118 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5995  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.37 
 
 
142 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  38.67 
 
 
132 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.77 
 
 
142 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.67 
 
 
132 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.58 
 
 
138 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  30.17 
 
 
117 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  34.58 
 
 
139 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 
139 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.5 
 
 
158 aa  55.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.58 
 
 
139 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.43 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.44 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  35.65 
 
 
136 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3640  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.64 
 
 
115 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>