More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7695 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  100 
 
 
324 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  63.14 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  63.14 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  63.14 
 
 
332 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  63.14 
 
 
332 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  62.62 
 
 
332 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  63.14 
 
 
332 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  63.14 
 
 
332 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  61.34 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  61.02 
 
 
332 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  60.7 
 
 
332 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  61.02 
 
 
332 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  61.02 
 
 
332 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  60.7 
 
 
355 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  60.7 
 
 
355 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 
332 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  59.74 
 
 
334 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  60.38 
 
 
325 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  59.42 
 
 
332 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  58.47 
 
 
332 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
401 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  52.68 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  52.68 
 
 
369 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  52.68 
 
 
341 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  52.68 
 
 
341 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  52.68 
 
 
365 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  52.68 
 
 
365 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  51.74 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  51.74 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  52.68 
 
 
421 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  51.74 
 
 
341 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  52.05 
 
 
338 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  51.74 
 
 
341 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  51.42 
 
 
371 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  52.37 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  50.79 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  50.79 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  51.42 
 
 
338 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  50.48 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  50.8 
 
 
343 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  50.16 
 
 
333 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  43.57 
 
 
375 aa  275  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1108  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  55.74 
 
 
241 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110935  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 
367 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  43.22 
 
 
367 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
353 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 
367 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 
339 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 
324 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  42.77 
 
 
364 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  43.55 
 
 
367 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  42.59 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 
368 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 
368 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 
368 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 
368 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 
368 aa  262  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 
334 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
337 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  41.01 
 
 
337 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 
344 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  41.19 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  37.46 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 
339 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  40.88 
 
 
343 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 
340 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 
338 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 
334 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  41.04 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  39.09 
 
 
336 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 
314 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 
344 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
319 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  38.31 
 
 
325 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
315 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 
315 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  39.55 
 
 
324 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  38.31 
 
 
314 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 
339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  35.81 
 
 
334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  38.46 
 
 
331 aa  225  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
322 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  39.43 
 
 
316 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  34.7 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 
337 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  40.38 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  37.13 
 
 
339 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
335 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 
331 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
401 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  38.66 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>