More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2746 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  100 
 
 
366 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3423  ThiJ/PfpI domain-containing protein  79.78 
 
 
366 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  79.51 
 
 
366 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4743  ThiJ/PfpI  82.2 
 
 
338 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2645  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.78 
 
 
373 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2944  ThiJ/PfpI  41.22 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3893  ThiJ/PfpI domain protein  42.09 
 
 
385 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.07 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4364  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.14 
 
 
403 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.54 
 
 
444 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  27.38 
 
 
492 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
198 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  40 
 
 
331 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  35.03 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.54 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  44.72 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  33.55 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  41.79 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  30.27 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.13 
 
 
199 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  31.53 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 
305 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  28.81 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.86 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  34.59 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  40.29 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  31.52 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.08 
 
 
198 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  41.32 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  32.24 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  30.81 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.95 
 
 
207 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  34.16 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.71 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  34.97 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.22 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  38.4 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  39.34 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.27 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  33.51 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  40.5 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.34 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  29.51 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  34.12 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.12 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  28.89 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  35.29 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  34.21 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  38.93 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  37.5 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
198 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  37.96 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  38.26 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  35.85 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  32.28 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  36.89 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  36.22 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  33.15 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  34.13 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  40 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.84 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  32.5 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>