More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1014 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1014  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 347 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131098  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3934  LysR family transcriptional regulator  91.09 
 
 		 305 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4924  LysR family transcriptional regulator  73.51 
 
 		 306 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0955  LysR family transcriptional regulator  68.23 
 
 		 304 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6326  transcriptional regulator, LysR family  67.77 
 
 		 304 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2897  LysR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1770  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5377  transcriptional regulator, LysR family  65.08 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5293  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143312  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02650  putative malonate utilization transcriptional regulator  50.17 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883739  normal  0.518056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0301  malonate utilization transcriptional regulator  50.17 
 
 		 309 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5078  malonate utilization transcriptional regulator  48.15 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10390  malonate utilisation transciptional regulator, LysR family  49 
 
 		 305 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0451  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.81 
 
 		 308 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1239  transcriptional regulator, LysR family  48.86 
 
 		 310 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3862  transcriptional regulator, LysR family  52.03 
 
 		 301 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.484372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4938  transcriptional regulator, LysR family  52.03 
 
 		 301 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.182259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2874  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0140369  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2743  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3771  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368263  normal  0.0120548 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0626  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 302 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742904  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2604  transcriptional regulator, LysR family  46.67 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3660  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  39.33 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1230  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 300 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.82 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 300 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  24.1 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  26.2 
 
 		 299 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.01 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 296 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 298 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  24.19 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  24.19 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 307 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 308 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06400  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 305 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 292 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.56 
 
 		 297 aa  92.8  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  23.7 
 
 		 303 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2003  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  24.05 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.25 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.69 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  27.54 
 
 		 293 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  23.86 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  26.51 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4455  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  23.02 
 
 		 288 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.1 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 297 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 301 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 295 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  27.8 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.56 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  26.56 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.48 
 
 		 290 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4029  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 299 aa  86.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.29 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  25.29 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  24.23 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  23.59 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.29 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.29 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.29 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  25.29 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>