More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0966 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  100 
 
 
379 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  76.84 
 
 
379 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  74.11 
 
 
379 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  73.84 
 
 
379 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  57.3 
 
 
382 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  53.41 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  56.55 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  54.19 
 
 
387 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  54.87 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  55.06 
 
 
399 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  51.74 
 
 
418 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  42.94 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  39.28 
 
 
410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  40.61 
 
 
412 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  38.85 
 
 
412 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  40.33 
 
 
390 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  40.33 
 
 
412 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  41.58 
 
 
378 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  40.33 
 
 
412 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  40.33 
 
 
412 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  39.66 
 
 
412 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  40.33 
 
 
412 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  40.33 
 
 
412 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  42.99 
 
 
429 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  39.35 
 
 
390 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  37.14 
 
 
423 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  38.07 
 
 
420 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  38.07 
 
 
420 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  37.2 
 
 
427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  37.43 
 
 
417 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  40.55 
 
 
387 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  40.86 
 
 
405 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  41.95 
 
 
442 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  41.94 
 
 
374 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  38.37 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  39.22 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  37.43 
 
 
386 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  40.23 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  40.23 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  37.81 
 
 
386 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  40.51 
 
 
405 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  40.79 
 
 
405 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  40.51 
 
 
405 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  40.51 
 
 
405 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  37.4 
 
 
377 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  37.7 
 
 
384 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  38.84 
 
 
378 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  36.27 
 
 
417 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  39.89 
 
 
403 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  38.64 
 
 
371 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  38.35 
 
 
371 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  34.44 
 
 
378 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  38.83 
 
 
384 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  40.88 
 
 
379 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  39.13 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  38.67 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  35.29 
 
 
390 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  36.86 
 
 
385 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  38.06 
 
 
385 aa  195  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  40.34 
 
 
394 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.71 
 
 
763 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.23 
 
 
765 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  37.91 
 
 
390 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.4 
 
 
757 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.4 
 
 
757 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.4 
 
 
757 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.4 
 
 
757 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.4 
 
 
757 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.4 
 
 
757 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.4 
 
 
757 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  34.73 
 
 
365 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.97 
 
 
757 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
777 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  33.33 
 
 
357 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  33.53 
 
 
358 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  32.36 
 
 
356 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  31.83 
 
 
341 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  31.4 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  31.4 
 
 
341 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  30.14 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  31.74 
 
 
376 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  29.57 
 
 
339 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.8 
 
 
377 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  31.71 
 
 
340 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  32.59 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  31.68 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  29.5 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  32.17 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  31.94 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  36.67 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  28.97 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  31.62 
 
 
414 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  31.03 
 
 
386 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  28.76 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  28.25 
 
 
348 aa  92.8  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  32.87 
 
 
347 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  31.42 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  29.48 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  31.25 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  30.19 
 
 
306 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>