More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5038 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  90.64 
 
 
342 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
342 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  90.94 
 
 
342 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  91.25 
 
 
343 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  90.94 
 
 
342 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  90.38 
 
 
343 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  88.01 
 
 
342 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  73.68 
 
 
343 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  73.39 
 
 
343 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  72.22 
 
 
342 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
342 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
648 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
659 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
630 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
630 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
639 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
604 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
604 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
604 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
604 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  90.32 
 
 
63 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
253 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
253 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
225 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  27.7 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  27.7 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
254 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  36.42 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
253 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  27.23 
 
 
253 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 
251 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  32 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  29.71 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  31.11 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 
251 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  23.85 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  34 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  42.2 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.21 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  30.56 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 
129 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  29.23 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  49.33 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  46.24 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  33.81 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  31.84 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  36.52 
 
 
136 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
134 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  55.56 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  45.59 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
136 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
158 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  25.41 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
145 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  39.42 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  37.74 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  24.38 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  44.44 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  31.61 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  34.17 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  26.33 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0114  MerR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>