More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4896 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4896  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0462854  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
256 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
258 aa  218  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1147  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.65 
 
 
295 aa  208  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  39.77 
 
 
263 aa  178  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0326  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.31 
 
 
279 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.31 
 
 
279 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.31 
 
 
279 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.4 
 
 
290 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53721  normal  0.207776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 
281 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312689  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 
281 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1517  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
263 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4503  reductase  35.43 
 
 
267 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  33.08 
 
 
259 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.77 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.78 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.78 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1874  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.46 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00756891  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_51114  predicted protein  29.44 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622765  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  26.49 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.03 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.77 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.63 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  28.57 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6803  hypothetical protein  26.28 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.72 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.39 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000715788  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.03 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.46 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4796  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.68 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616684  normal  0.0456615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2084  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.31 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  23.93 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379733  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  28.68 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01741  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  26.82 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.74 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  26.77 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3499  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.88 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000200481  hitchhiker  0.00699143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.97 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.951488  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0374  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  25.76 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.333975  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191512  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2035  putative gluconate 5-dehydrogenase  26.2 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0913776  normal  0.102555 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4885  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.31 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  26.77 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.06 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2733  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.89 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.35 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>