286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6593 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  100 
 
 
497 aa  976    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  76.46 
 
 
549 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  99.6 
 
 
497 aa  969    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  75.4 
 
 
534 aa  710    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  92.74 
 
 
497 aa  885    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  92.34 
 
 
497 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  99.6 
 
 
497 aa  969    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.26 
 
 
549 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.6 
 
 
495 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.27 
 
 
497 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  62.66 
 
 
504 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  60.89 
 
 
495 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  54.36 
 
 
513 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  52.9 
 
 
513 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  53.88 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  53.32 
 
 
507 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  53.07 
 
 
500 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  53.21 
 
 
523 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  53.62 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  51.14 
 
 
507 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
507 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  43.23 
 
 
509 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  39.02 
 
 
516 aa  320  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  40.49 
 
 
507 aa  316  6e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.72 
 
 
506 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.32 
 
 
508 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  40.61 
 
 
526 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  38.6 
 
 
508 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
505 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  40.18 
 
 
511 aa  289  7e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 
505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 
505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 
498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 
520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
506 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 
505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  45.11 
 
 
508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  44.85 
 
 
508 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.89 
 
 
508 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  42.37 
 
 
499 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  41.28 
 
 
514 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 
504 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.5 
 
 
504 aa  279  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  40.83 
 
 
497 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.94 
 
 
516 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  42.83 
 
 
509 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  41 
 
 
513 aa  276  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  41.22 
 
 
515 aa  276  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  35.59 
 
 
523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 
507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  40.6 
 
 
504 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  39.1 
 
 
510 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  37.92 
 
 
522 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  36.93 
 
 
497 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  42.96 
 
 
512 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  39.05 
 
 
513 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 
511 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  39.85 
 
 
536 aa  266  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.32 
 
 
508 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  43.5 
 
 
512 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  38.64 
 
 
513 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  38.32 
 
 
513 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  38.53 
 
 
513 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  38.32 
 
 
513 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  39.13 
 
 
524 aa  263  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  38.32 
 
 
513 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  37.08 
 
 
519 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  38.32 
 
 
513 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  39.49 
 
 
507 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  39.61 
 
 
514 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  39.92 
 
 
511 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  37.55 
 
 
510 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  36.44 
 
 
510 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  37.48 
 
 
510 aa  260  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  40.08 
 
 
506 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
506 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  38.53 
 
 
510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  41.36 
 
 
515 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  38.9 
 
 
506 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  40.67 
 
 
514 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  37.29 
 
 
511 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  39.19 
 
 
509 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  42.09 
 
 
514 aa  259  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
513 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
513 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  37.5 
 
 
513 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  38.68 
 
 
506 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  40.7 
 
 
518 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  38.68 
 
 
506 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  37.07 
 
 
514 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  37.72 
 
 
510 aa  256  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  38.51 
 
 
511 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  37.81 
 
 
511 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>