58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5947 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3957  patatin  97.92 
 
 		 336 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  97.92 
 
 		 336 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  100 
 
 		 336 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  64.58 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  64.58 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  64.58 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  64.29 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  64.29 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  64.29 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  64.29 
 
 		 375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  64.29 
 
 		 333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  33.9 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  30.06 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  34.23 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  33.21 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  33.43 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  32.84 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  30.95 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  30.21 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  31.72 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  33.47 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  37.32 
 
 		 686 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  33.05 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  27.25 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  26.67 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  30.13 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  32.79 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  32.64 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  28.75 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  29.78 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  26.25 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  30.39 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  32.33 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  30.5 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  26.2 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  30.24 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1002 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  31.6 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  31.6 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  31.6 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  30.74 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  26.5 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  31.4 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.16 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  33.49 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  30 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  29.07 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  28.21 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  28.14 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  27.33 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  25.84 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  27.82 
 
 		 1678 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  24.23 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  26.46 
 
 		 554 aa  53.9  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  26.71 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  23.69 
 
 		 615 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  27.05 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  22.18 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>