More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3192 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1678  Cl- channel, voltage gated  90.31 
 
 		 444 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4220  chloride channel core  88.16 
 
 		 425 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4037  Cl- channel, voltage gated  95.04 
 
 		 444 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3192  chloride channel core  100 
 
 		 421 aa  811    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  88.15 
 
 		 445 aa  698    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4329  Cl- channel, voltage-gated family protein  95.04 
 
 		 444 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4280  chloride channel core  83.45 
 
 		 448 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  72.87 
 
 		 443 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  69.92 
 
 		 443 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1040  voltage gated chloride channel family protein  68.59 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0608  voltage gated chloride channel family protein  68.59 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1126  chloride channel (ClC) family protein  68.59 
 
 		 476 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2340  voltage gated chloride channel family protein  68.59 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0859  voltage gated chloride channel family protein  68.59 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1825  voltage gated chloride channel family protein  68.59 
 
 		 476 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1861  hypothetical protein  54.34 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1856  hypothetical protein  55.19 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0576  Cl- channel, voltage-gated family protein  57.11 
 
 		 416 aa  359  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0254  Chloride channel core  36.8 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6206  Chloride channel core  39.25 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  32.3 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1016  chloride channel, core  32.78 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0706  chloride channel protein EriC  33.61 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.208115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0799  chloride channel protein EriC  34.07 
 
 		 427 aa  167  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  30.79 
 
 		 579 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.1 
 
 		 591 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0881  chloride transporter, ClC family  29.45 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  34.02 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.87 
 
 		 598 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4538  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.07 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.38 
 
 		 593 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.38 
 
 		 593 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  28.82 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.1 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.76 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.1 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  31.14 
 
 		 608 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0688  chloride channel protein  36.58 
 
 		 488 aa  113  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  29.94 
 
 		 627 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.12 
 
 		 636 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.12 
 
 		 579 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  31.19 
 
 		 669 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.33 
 
 		 628 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.12 
 
 		 579 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.12 
 
 		 579 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.58 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.36 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.36 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.59 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.45 
 
 		 591 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.44 
 
 		 606 aa  99.8  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.12 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.91 
 
 		 613 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.45 
 
 		 591 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.33 
 
 		 560 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.87 
 
 		 602 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  31.1 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.29 
 
 		 461 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.37 
 
 		 569 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.55 
 
 		 591 aa  93.2  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  28.93 
 
 		 596 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  32.67 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  28.4 
 
 		 603 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2439  chloride channel core protein  31.06 
 
 		 589 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3746  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.1 
 
 		 414 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  29.49 
 
 		 627 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.88 
 
 		 587 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.49 
 
 		 631 aa  89  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.96 
 
 		 863 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.21 
 
 		 538 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2526  Chloride channel core  30.79 
 
 		 589 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  28.57 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  28.57 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  26.62 
 
 		 519 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  29.97 
 
 		 471 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.42 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.28 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.12 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  28.91 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.57 
 
 		 603 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.9 
 
 		 582 aa  83.2  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3883  chloride channel core  29.97 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.44 
 
 		 577 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  30.06 
 
 		 628 aa  83.2  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.72 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.72 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.72 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  24.12 
 
 		 595 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  29.78 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.28 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  28.41 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.41 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.96 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.96 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.96 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.96 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.96 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  28.41 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  27.17 
 
 		 585 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  26.05 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>