45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0209 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.579459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1843  hypothetical protein  80.26 
 
 		 234 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1701  gp33  66.09 
 
 		 233 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1929  gp33  61.98 
 
 		 189 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4381  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1128  hypothetical protein  45.73 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1139  hypothetical protein  45.3 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0226  hypothetical protein  34.03 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4873  hypothetical protein  37.39 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6066  hypothetical protein  36.6 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1498  hypothetical protein  71.43 
 
 		 84 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1281  gp33  80.95 
 
 		 64 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2449  hypothetical protein  41.35 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4344  hypothetical protein  34.93 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1661  hypothetical protein  36.49 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.823768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1045  hypothetical protein  81.13 
 
 		 126 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024831  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4665  hypothetical protein  30.74 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16454  normal  0.237072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4073  hypothetical protein  38.81 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.052913  normal  0.124399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  31.48 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2224  hypothetical protein  30.12 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  38.57 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1950  hypothetical protein  32.48 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865954  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5208  hypothetical protein  29.94 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1766  hypothetical protein  76.92 
 
 		 73 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2378  hypothetical protein  76.92 
 
 		 73 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4717  protein of unknown function DUF159  27.63 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143313 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4144  hypothetical protein  30.69 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352175  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6967  protein of unknown function DUF159  26.15 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.682444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  32.52 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  27.95 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  25.5 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3101  protein of unknown function DUF159  31.06 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2783  protein of unknown function DUF159  28.36 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  28.95 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3882  hypothetical protein  26.13 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0171442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3812  hypothetical protein  27.39 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.364494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6423  protein of unknown function DUF159  26.21 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5645  protein of unknown function DUF159  25.85 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0573  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  27.34 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2524  hypothetical protein  31.51 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  26.83 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.99 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3635  hypothetical protein  24.9 
 
 		 241 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>