58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3957 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3957  patatin  100 
 
 		 336 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  100 
 
 		 336 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  97.92 
 
 		 336 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  64.88 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  64.88 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  64.88 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  64.58 
 
 		 375 aa  454  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  64.58 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  64.58 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  64.58 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  64.29 
 
 		 333 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  34.76 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  29.49 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  34.23 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  32.82 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  33.43 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  29.85 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  32.17 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  32.45 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  33.21 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  29.91 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  37.32 
 
 		 686 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  34.6 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  28.21 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  29.75 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  26.96 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  33.2 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  27.58 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  29.1 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  32.78 
 
 		 363 aa  92.4  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  27.38 
 
 		 390 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  30.39 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  27.33 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  25.85 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  32.33 
 
 		 324 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1002 aa  87.8  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  30.91 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  32.03 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  32.03 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  32.03 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  31 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  26.5 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  31.12 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  29.73 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  33.18 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  29.57 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  29.61 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  28.94 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  28.14 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  26.59 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  29.06 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  28.2 
 
 		 1678 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  25.62 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  26.95 
 
 		 554 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  26.94 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  27.11 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  22.18 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  39.74 
 
 		 615 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>