More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2881 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2881  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0102206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  64.36 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0479  transcriptional regulator, ArsR family  57.84 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.741609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3317  regulatory protein, ArsR  58.72 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0899623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3039  regulatory protein, ArsR  60.4 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5737  ArsR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.303432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2519  regulatory protein ArsR  60.2 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5359  ArsR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3553  regulatory protein, ArsR  63.37 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5449  ArsR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3252  regulatory protein ArsR  61.76 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0485  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.45 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30170  transcriptional regulator, ArsR family  54 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.758763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2780  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  38.74 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 		 330 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  39.58 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.16 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  37.72 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  40.4 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  39.36 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0682  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  36.84 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2636  regulatory protein, ArsR  39.22 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  36.79 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2326  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.323993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2373  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2365  ArsR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291211  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2047  regulatory protein, ArsR  33.64 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.314568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  34.95 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3704  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.772956  normal  0.469506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.5 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  39.8 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2213  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2597  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  34.26 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 250 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  35.23 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.45 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.89 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  38.14 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0828  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.99 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4896  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434432  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  33.66 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  31.07 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  37.62 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  34.95 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0788  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3951  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542823  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4252  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.926264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>