More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1660 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
346 aa  685    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  55.33 
 
 
347 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  53.35 
 
 
344 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  42.18 
 
 
330 aa  262  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  43.33 
 
 
334 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1243  oxidoreductase domain-containing protein  38.17 
 
 
318 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  33.9 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.34 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  27.01 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.04 
 
 
358 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  32.86 
 
 
370 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.87 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01210  predicted dehydrogenase  41.95 
 
 
319 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
326 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
458 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
468 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  38.05 
 
 
317 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
321 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  35.55 
 
 
342 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
344 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 
356 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  32.15 
 
 
344 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
347 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  30.11 
 
 
337 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
387 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  37.78 
 
 
343 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  29.83 
 
 
337 aa  99.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.24 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
435 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  35.81 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  38.32 
 
 
331 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  31.65 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  29.79 
 
 
375 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 
359 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.81 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  22.88 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0639  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
435 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.1 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.17 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2909  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.860275  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.45 
 
 
337 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  35.55 
 
 
342 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  39.65 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
366 aa  86.7  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.29 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  23.3 
 
 
349 aa  86.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 
433 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  32.11 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.89 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3617  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3571  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.785153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  37.23 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.86 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  29.12 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.23 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.51 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  37.84 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  36.81 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  37.31 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  22.99 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.41 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>