66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0914 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  100 
 
 
1086 aa  2162    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  32.37 
 
 
873 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  35.02 
 
 
1276 aa  204  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 
1343 aa  154  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  39.01 
 
 
1141 aa  136  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  28.4 
 
 
554 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  27.17 
 
 
564 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  28.25 
 
 
448 aa  104  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  27.72 
 
 
562 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.97 
 
 
662 aa  90.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  30.94 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  30.94 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  30.94 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  26.5 
 
 
803 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  27.4 
 
 
801 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  27.68 
 
 
891 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  28.85 
 
 
604 aa  78.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.76 
 
 
605 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.4 
 
 
602 aa  75.1  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  24.49 
 
 
326 aa  73.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  26.6 
 
 
659 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  27.1 
 
 
658 aa  71.2  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  28.69 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  28.69 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  28.69 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  28.69 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  28.69 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  28.69 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  28.69 
 
 
442 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  27.58 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  29.12 
 
 
596 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  26.8 
 
 
640 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  23.56 
 
 
614 aa  64.7  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  26.52 
 
 
763 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  29.17 
 
 
534 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 
437 aa  63.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  24.68 
 
 
760 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  25 
 
 
743 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  26.3 
 
 
772 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  27.31 
 
 
340 aa  58.9  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  26.36 
 
 
482 aa  58.9  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.38 
 
 
453 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  24.42 
 
 
489 aa  56.2  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  23.21 
 
 
447 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  26.59 
 
 
457 aa  56.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  27.53 
 
 
748 aa  55.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  27.95 
 
 
508 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  33.96 
 
 
392 aa  55.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0820  hypothetical protein  25.47 
 
 
761 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  28.64 
 
 
500 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  35.1 
 
 
372 aa  52  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.57 
 
 
584 aa  51.6  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  24.1 
 
 
436 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  22.75 
 
 
544 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  27.14 
 
 
444 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  24.7 
 
 
425 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  26.67 
 
 
442 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  26.19 
 
 
442 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 
437 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3567  hypothetical protein  25.32 
 
 
1798 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.621176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  29.68 
 
 
380 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
684 aa  46.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  25.97 
 
 
1223 aa  46.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  24.14 
 
 
437 aa  45.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  26.56 
 
 
426 aa  45.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  26.53 
 
 
460 aa  45.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>