More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2195 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5467  major facilitator transporter  91.19 
 
 		 471 aa  859    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  72.07 
 
 		 470 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  74.33 
 
 		 468 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5919  major facilitator transporter  94.12 
 
 		 470 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2195  major facilitator transporter  100 
 
 		 481 aa  948    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1113  major facilitator transporter  86.37 
 
 		 468 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2068  major facilitator transporter  96.47 
 
 		 474 aa  906    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.680279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  71.4 
 
 		 469 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2176  major facilitator transporter  93.7 
 
 		 470 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2158  major facilitator transporter  94.12 
 
 		 470 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  51.57 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  48.96 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  47.09 
 
 		 433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  44.03 
 
 		 436 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 436 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 436 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 436 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 436 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 436 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  45.15 
 
 		 524 aa  334  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  45.31 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  45.31 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  45.31 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  45.31 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  45.31 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  45.31 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  44.73 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.21 
 
 		 433 aa  329  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  45.48 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  45.24 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  47.55 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  45.24 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  45.01 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 437 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  47.97 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  47.97 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 434 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  47.97 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  47.97 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  47.97 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  43.49 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  43.52 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  47.88 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  43.49 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 439 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 446 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 444 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 439 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4983  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 441 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5285  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 441 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.38 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.46 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 450 aa  289  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 439 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2147  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426847  normal  0.887871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.13 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  38.89 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  38.66 
 
 		 436 aa  279  6e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  41.04 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.82 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.82 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  43.39 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.82 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.61 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.8 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.52 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  41.07 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.38 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  41.06 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.19 
 
 		 435 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.19 
 
 		 435 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.05 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  41.69 
 
 		 432 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  39.68 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>