More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2077 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  79.45 
 
 		 174 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  79.45 
 
 		 174 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  79.45 
 
 		 174 aa  249  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  79.45 
 
 		 174 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  57.82 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 		 159 aa  183  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  58.39 
 
 		 176 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  57.72 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  57.72 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 		 171 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  54.68 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  53.57 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.28 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  44.03 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  44.03 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  42.54 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  42.54 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  43.7 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  43.8 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  43.7 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  40.58 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.15 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  41.3 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  43.07 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.15 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  40.88 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  40.88 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  40.88 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  40.6 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  41.41 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.15 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  41.48 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.48 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  38.16 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  38.16 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  38.16 
 
 		 222 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>