67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0717 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  100 
 
 
314 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  99.04 
 
 
314 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  99.04 
 
 
315 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  89.21 
 
 
315 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  66.13 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  66.56 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  65.29 
 
 
313 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  67.41 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  67.41 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  66.77 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  65.15 
 
 
306 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  57.01 
 
 
314 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  57.01 
 
 
314 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  61.98 
 
 
313 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  34.25 
 
 
364 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  37.77 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  37.77 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  42.17 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  39.65 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  36.16 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  39.47 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  39.21 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  39.21 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  41.52 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  41.52 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  41.52 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  41.52 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  41.52 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  41.52 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  41.52 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  39.77 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  27.55 
 
 
316 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  35.02 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  34.28 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  34.78 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.39 
 
 
578 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  31.55 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  31.79 
 
 
299 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  32.3 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  32.3 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 
560 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  31.45 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  30.97 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  31.28 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.77 
 
 
310 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  35.4 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 
565 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  20.47 
 
 
549 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 
564 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  31.56 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  31.33 
 
 
309 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  19.29 
 
 
544 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.78 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  20.78 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  19.29 
 
 
544 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.35 
 
 
927 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  19.29 
 
 
544 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  18.9 
 
 
547 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  19.29 
 
 
549 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  20.47 
 
 
547 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  27.01 
 
 
686 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  19.69 
 
 
544 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  37.35 
 
 
632 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  19.69 
 
 
547 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 
571 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  27.71 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 
559 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>