More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0889 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
348 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  96.74 
 
 
407 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  96.83 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  96.83 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  96.83 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  96.83 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  96.83 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  96.83 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  82.54 
 
 
252 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  81.67 
 
 
252 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  81.67 
 
 
252 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  81.67 
 
 
252 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  81.27 
 
 
252 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  81.27 
 
 
252 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  81.35 
 
 
266 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  70.92 
 
 
251 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  70.12 
 
 
251 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  70.52 
 
 
251 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  59.2 
 
 
251 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
288 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  34.41 
 
 
252 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
254 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
260 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 
260 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.54 
 
 
252 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.54 
 
 
252 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.46 
 
 
252 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
296 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 
252 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.75 
 
 
252 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 
258 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.14 
 
 
252 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
252 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  36.72 
 
 
256 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.35 
 
 
252 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
258 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.89 
 
 
252 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4038  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  31.84 
 
 
276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.18 
 
 
250 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.56 
 
 
252 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
253 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
268 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 
253 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 
267 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
289 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.81 
 
 
257 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  37.09 
 
 
252 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  37.09 
 
 
252 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  31.45 
 
 
263 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
245 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 
256 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  37.09 
 
 
252 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.05 
 
 
257 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  34.15 
 
 
257 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  31.45 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
256 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  35.69 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 
257 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 
252 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 
257 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
257 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
263 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  30.74 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.2 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  29.84 
 
 
270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 
252 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
261 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
259 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.37 
 
 
314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
251 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
256 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  29.27 
 
 
269 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.464213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.27 
 
 
261 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  29.27 
 
 
261 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  29.27 
 
 
261 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
262 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.6 
 
 
257 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
261 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  30.08 
 
 
262 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>