48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0547 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  98.41 
 
 		 314 aa  638    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  100 
 
 		 314 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4412  endoglucanase family protein  75.8 
 
 		 314 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239026  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  57.59 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  58.39 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  54.41 
 
 		 322 aa  321  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  53.51 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  49.51 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  49.51 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  53.91 
 
 		 307 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  38.85 
 
 		 880 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.85 
 
 		 886 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3043  Beta-mannanase-like protein  26.64 
 
 		 558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0756266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  30.92 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  30.92 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  30.92 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  30.45 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  34.31 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  29.44 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  29.79 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  27.12 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  31.16 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  27.78 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  33.33 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  28.4 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.03 
 
 		 900 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  25.15 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 1231 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  23.47 
 
 		 519 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  27.68 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0154  hypothetical protein  23.57 
 
 		 424 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  24.05 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.71 
 
 		 519 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  25.73 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  24.75 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  27.87 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  25.68 
 
 		 620 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  22.78 
 
 		 533 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  36.78 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  25.17 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48536  predicted protein  27.74 
 
 		 486 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0226991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4957  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.59 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  25.83 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  22.56 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  33.72 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  27.78 
 
 		 520 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2276  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  28.69 
 
 		 532 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000457486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>