85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1468 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1468  choloylglycine hydrolase family protein  100 
 
 
333 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1422  choloylglycine hydrolase family protein  100 
 
 
394 aa  692    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1703  penicillin amidase  74.92 
 
 
369 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1447  choloylglycine hydrolase  52.99 
 
 
366 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0916  penicillin amidase  52.88 
 
 
336 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3557  Penicillin amidase  46.5 
 
 
367 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0690  Choloylglycine hydrolase  42.06 
 
 
401 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1576  choloylglycine hydrolase  38.95 
 
 
373 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3538  choloylglycine hydrolase  38.96 
 
 
328 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3779  choloylglycine hydrolase family protein  38.65 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0181164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3508  choloylglycine hydrolase  38.65 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3807  choloylglycine hydrolase family protein  38.34 
 
 
328 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3898  choloylglycine hydrolase family protein  38.34 
 
 
328 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3611  choloylglycine hydrolase family protein  38.34 
 
 
328 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3801  choloylglycine hydrolase family protein  38.34 
 
 
328 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02193  hypothetical protein  39.51 
 
 
363 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4255  choloylglycine hydrolase  37.12 
 
 
328 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1046  choloylglycine hydrolase  37.92 
 
 
328 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2365  choloylglycine hydrolase  36.88 
 
 
362 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1038  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  36.7 
 
 
333 aa  200  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0705  choloylglycine hydrolase  35.84 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.984776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1155  choloylglycine hydrolase family protein  32.92 
 
 
326 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1348  choloylglycine hydrolase family protein  32.62 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00388269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0227  penicillin V acylase, putative  32.09 
 
 
326 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2364  choloylglycine hydrolase  33.13 
 
 
368 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421243  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0536  conjugated bile acid hydrolase  30.34 
 
 
317 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.969488  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12270  penicillin V acylase-like amidase  31.17 
 
 
315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0643  choloylglycine hydrolase  31.8 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0992  choloylglycine hydrolase  30.57 
 
 
397 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0259  penicillin amidase  27.35 
 
 
330 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0266  penicillin amidase  27.35 
 
 
330 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0054  conjugated bile salt hydrolase-like protein  30.53 
 
 
316 aa  142  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0730  choloylglycine hydrolase  29.79 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000286672  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1652  choloylglycine hydrolase  28.88 
 
 
363 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.756503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1711  choloylglycine hydrolase  28.88 
 
 
363 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1796  choloylglycine hydrolase  28.88 
 
 
363 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1630  choloylglycine hydrolase  28.88 
 
 
362 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1644  choloylglycine hydrolase  28.88 
 
 
363 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0959  penicillin V acylase related amidase  29.18 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555558  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0575  choloylglycine hydrolase  29.24 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2085  Choloylglycine hydrolase  31.1 
 
 
355 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0747  Choloylglycine hydrolase  31.7 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2150  penicillin V acylase precursor. cysteine peptidase. MEROPS family C59  31.77 
 
 
347 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.17622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1920  choloylglycine hydrolase  31.67 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0839  Choloylglycine hydrolase  29.87 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000470  choloylglycine hydrolase family protein  28.16 
 
 
429 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0876  choloylglycine hydrolase  29.77 
 
 
354 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2831  choloylglycine hydrolase  31.86 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0142441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2282  Choloylglycine hydrolase  29.24 
 
 
355 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3412  choloylglycine hydrolase  30.33 
 
 
357 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107785  normal  0.0295441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1745  Choloylglycine hydrolase  28.9 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1956  twin-arginine translocation pathway signal  27.76 
 
 
355 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550247  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2503  Choloylglycine hydrolase  29.33 
 
 
356 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2883  choloylglycine hydrolase, putative  29.33 
 
 
356 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2387  choloylglycine hydrolase family protein  28.83 
 
 
352 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389059  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1699  choloylglycine hydrolase  30.23 
 
 
355 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2225  Choloylglycine hydrolase  30.33 
 
 
358 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5516  choloylglycine hydrolase  28.26 
 
 
337 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1302  choloylglycine hydrolase  28.67 
 
 
327 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6641  Choloylglycine hydrolase  28.24 
 
 
359 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3497  choloylglycine hydrolase  27.09 
 
 
355 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2127  choloylglycine hydrolase  30.23 
 
 
427 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.677664  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3119  Choloylglycine hydrolase  28.19 
 
 
331 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0911  choloylglycine hydrolase  28.62 
 
 
349 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599799  normal  0.124985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3467  choloylglycine hydrolase  27.33 
 
 
376 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0580  penicillin V acylase or related amidase  27.84 
 
 
308 aa  99  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2991  Choloylglycine hydrolase  30.12 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1884  Choloylglycine hydrolase  29.43 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3821  choloylglycine hydrolase  27.48 
 
 
358 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0697  choloylglycine hydrolase  34.57 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1281  Choloylglycine hydrolase  31.19 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3501  Choloylglycine hydrolase  27.16 
 
 
342 aa  90.1  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4334  choloylglycine hydrolase  28.09 
 
 
341 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.684328  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4129  Choloylglycine hydrolase  27.15 
 
 
358 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05258  penicillin acylase  29.6 
 
 
371 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2943  choloylglycine hydrolase  28.05 
 
 
346 aa  85.9  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0360  putative hydrolase  29.13 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5004  Choloylglycine hydrolase  24.92 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0837  hypothetical protein  28.36 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0866  hypothetical protein  27.99 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4062  Choloylglycine hydrolase  25.69 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3411  choloylglycine hydrolase  24.71 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0442  choloylglycine hydrolase  25.68 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.264988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4492  choloylglycine hydrolase  24.33 
 
 
354 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5941  Penicillin V acylase and related amidase-like protein  31.36 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>